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IO的Biomarker转化与开发模式
多维度肿瘤免疫标志物转化研究平台
定制化的Biomarker的开发与验证

药物研发是一个反复学习和验证的过程,这个过程会带来高质量、高效率的研究,最终帮助每个研究阶段做出合理决定,进而提高研发成功的概率。而转化医学作为药物研发的关键环节,能够衔接临床前和临床,从而达到在疾病中选择合适的患者,并且针对疾病找到合适的生物靶点的目的,还能在临床试验恰当的疗效窗口建议合理的药物剂量,实现从“Basic Research—Translation—Clinical Studies—Reverse Translation”的循环验证过程。那biomarker如何提高整个药物开发的成功率呢,以NSCLC适应证药物为例,在III期临床试验中的成功率总体为28%,在靶向疗法中的成功率是31%,而在有CDx指导的靶向药物中的成功率却高达62%,也就是说,biomarker的应用明显提高了临床试验成功率。此外,不管是评估疗效,还是毒性反应和患病率,对比2007~2011年和2012~2016年临床试验中的biomarker的应用情况都出现了翻倍的增长。

Biomarker在药物临床研究中扮演的很多不同的角色,比如药效评估、预测疾病发生风险疾病早期诊断、毒性和药效的标志物等,随着对于生物标志物进一步的了解,药物的临床研究已经逐渐扩展了伴随诊断(CDx)的领域。以TMB为例,作为免疫疗法中一个新型biomarker,临床研究证明,TMB-H的患者和TMB-L或TMB-M的患者在O药中获益系数相差很大。2020年6月,TMB-H也作为Keytruda伴随诊断的标准通过了FDA的认证,也就是说,TMB突破了传统的适应症,在泛癌种中扩大了有效人群。

IO Biomarker Validation
新生抗原模型

裕策生物在新生抗原上不断升级预测模型,一直是行业领先,在方法学上分别进行了方法学优化及临床验证,陆续发表了文章。ioTNL是最新研发的标志物在肺癌二线单药,恶黑二线单药,肝内胆管癌一线联合,鼻咽癌二线单药5个队列证明了与PFS/OS相关,并且用YuceOne® panel检测表现优异

免疫微环境模型

Tumor inflammation signature(TIS)是Nanostring与Merk联合开发的免疫微环境基因表达谱标志物,在多个泛肿瘤临床队列中得到验证,裕策获得了nanostring授权的中国首家正版检测算法。Immune Exhaustion Signature(IES)是裕策自主开发15个基因的表达谱,在多队列伍肿瘤中完成了验证,裕策引进了nanostring平台,可以进行nCounter PanCancer IO 360 panel检测和数据分析服务,整合了34个潜在的免疫特征谱其中包含了TIS,能够快速得评估免疫侵袭,并且开发出可用于肿瘤免疫治疗的特征谱。多色组化解决方案作为肿瘤免疫学研究的全新技术得到广泛推崇,是当下最先进的组织原位细胞表型定量分析技术。

免疫组化进行靶点检测
PD-1/PD-L1抗体检测
PD-L1(SP263)Expression
PD-L1(22C3)Expression
其他免疫检查点抗体检测
TIM-3Expression
LAG-3Expression
IDOExpression
dMMR检测
dMMRExpression
靶向治疗靶点检测
c-METExpression
AXLExpression
EZH2Expression
Her-2 Expression
CD47Expression
EGFRExpression
外周血标志物

bTMB: 基于突变数量计算的TMB数值与组织TMB相关性较低,需要新的模型来做优化。通过机器学习(ML)模型预测出的bTMB数值比根据突变数量计算得到的bTMB数值更接近组织的TMB情况。

bMSI: 应用YuceOne® bTMB panel对血液样本进行bMSI检测,检测准确性为88.9%。

TCR: TCR的多样性以及治疗前后的动态变化与免疫治疗疗效相关,成果发表在AACR 2020会议上。

AI 360 immunogram多组学综合诊断模型
oTMB模型

 肿瘤的免疫原性与突变数量,能否被递呈,异质性有关

· TMB、ITH及HLA在方法学上分别进行了方法学优化及临床验证,TMB、ITH在泛肿瘤层面进行了验证,文章正在发表中

· oTMB 是 结合TMB、ITH及HLA是肿瘤基因组层面预测免疫治疗疗效比较有效的3个指标,对TMB进行优化,能同时在YuceOne® Plus芯片中实现检测

应用案例

全面评估 快速决策 —— YuceOne® Plus系列

裕策生物联合肿瘤基因组+免疫微环境+新生抗原呈递通路,多维信息助力临床科研与探索: 

裕策生物开发了一套基于YuceOne® Panel肿瘤单样本检测TMB的方法,与血液对照样本TMB的相关性达到0.93,同时在中国人群非小细胞肺癌队列中验证了免疫治疗疗效预测的价值。对照样本free的TMB方法在临床应用上更方便,可以降低成本、避免配对样本不一致的问题等,后续可在消化道肿瘤队列中验证免疫治疗临床预测价值。

裕策生物在TMB方面的三项专利:“用于肿瘤突变负荷检测的基因芯片及其制备方法和装置”、“一种肿瘤突变负荷检测方法、装置和存储介质”、 “肿瘤突变负荷检测方法、装置和存储介质”。

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