YuceOne®Reporter基因数据解读系统架构图:

新生抗原预测流程TrueNeon,TESLA认证国际领先水准

裕策生物开发的肿瘤新生抗原预测流程TrueNeon,可高效预测肿瘤的新生抗原序列。它基于肿瘤外显子和转录组数据,可同时检测体细胞点突变、体细胞插入缺失、病毒整合、结构性变异、融合基因等多种变异产生的变异肽段,并可预测以上变异肽段与MHC I和MHC II的亲和力,再分析变异基因表达水平、clonal状态、肽段同源性、肽段转运相关基因变异、蛋白质剪切相关基因变异,同时结合裕策生物独有的中国人群肿瘤neoantigen数据库,使用裕策生物开发的预测算法和软件,筛选出高质量的肿瘤新生抗原序列。

裕策生物新生抗原预测流程图

中国人群肿瘤TNB分布

对8种上千例中国人群常见肿瘤的全外显子测序数据进行突变产生的新生抗原预测,并计算TNB(Tumor neoantigens burden)。结果显示,TNB在肿瘤中分布具有异质性,非小细胞肺癌的中位TNB最高(4.38 个/Mb),微卫星稳定的结直肠癌的中位TNB最低(0.5 个/Mb)。肾细胞癌的TMB较低,却有较高的TNB,因为其肿瘤突变中indels较多。

案例研究

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